比较图元向量和点的聚类系数对差异网络的研究

【摘要】：差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点。网络节点往往通过与局部结构作用实现某种功能,其与局部结构的关系变化,很可能影响其功能。本文利用仿真实验的方法比较了图元向量和点的聚类系数两种局部结构测度的性能,并且利用他们分别设计算法挖掘差异网络中模块化变化的基因簇。应用AGEMAP数据库中小鼠12个组织基因表达数据进行实验,大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的GO项。

【关键词】： 差异网络 点的聚类系数 图元向量 小鼠衰老

【正文快照】：
系统生物研究表明:生命体的生长、发育、衰老过程以及疾病的发生与基因之间相互作用的变化密切相关。随着以微阵列技术为代表的各种高通量技术的飞速发展,人们可以同时观察到一个细胞中成千上万个基因的活动状况。如何利用这些数据挖掘出其中潜在变化,对于揭示衰老及疾病的发

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【参考文献】
 
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1 陈璟;基于代谢网络的产甲烷菌的耐热性研究[D];江南大学;2013年
2 郭杏莉;基于网络模型的基因相关预测问题算法研究[D];西安电子科技大学;2013年

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